人多能干细胞神经元分化过程中Polycomb群蛋白的ChIP-qPCR研究

摘要

神经元分化是一个复杂而复杂的过程，涉及多种信号通路、生长因子、转录因子和表观遗传修饰因子之间的相互作用。在神经元发育的不同阶段，有各种组蛋白修饰因子驱动系谱特异性基因的表达。Polycomb组蛋白是一种组蛋白修饰因子，在各种组织的发育、分化和功能中控制特定基因的转录抑制。染色质免疫沉淀(ChIP)是一种广泛用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术;ChIP结合实时定量PCR (quantitative real-time PCR, qPCR)可以得到特定DNA片段上特定蛋白质的占用率的定量数据，这有助于我们研究蛋白质如何调控特定基因的表达。在本章中，我们描述了一个在早期神经元分化过程中与qPCR相耦合的芯片协议，以识别由Polycomb抑制复合物1的成分调控的特定基因组靶点。