最新结果 Springer可用的最新内容beplay登入http://link.beplay登入springer.com. 在线工具和抗病毒数据库,用于对冠状病毒的毒品开发 抽象

当前冠状病毒大流行的危机迫切需要对研究人员,学生的急需提供科学信息,专业人士和记者。研究的科学信息昂贵,大多数大学和研究机构都无法在此危机时间内订阅所有与冠状病毒相关的期刊/文章。为了加快疫苗开发和发现抗Covid药物的过程,大多数制药公司,研究机构和出版商正在发挥关键作用,并在战争基础上工作,以便早期获得疫苗或防巢药尽可能。在电晕危机的测试时间中,每个人都需要集体努力。为了向科学界提供贡献,我们已经开始概述一些可用的工具和资源,可能在数据挖掘和筛查新铅分子向冠状病毒中提供了一些洞察力。我们收集并编制了开放访问在线工具和抗病毒数据库的信息,对于发现和开发Corona疫苗和抗Covid药物是必不可少的。开放访问工具包括开放教育资源(OERS),Google云,在线预测服务器,基于Web的观看者等,而抗病毒数据库包括合成和未经证明的化合物,抗病毒药物数据库,抗病毒肽等文库。该信息本章介绍将帮助研究人员直接在冠状病毒药物发现的项目中使用它们。http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_48 2021-04-24 10.1007/7653 _2020_48 Coronavirus发现的历史和最新进展 抽象

截至2020年9月6日,Covid-19大流行影响了188个国家,并传播截至26,924,131人。负责Covid-19的因果生物是从冠状病毒家族中重复的SARS-COV-2。Covid-19速度和速度的速度对医疗保健服务产生了沉重的负担,并导致了严格的公众帮助措施。这的结果是对Covid-19并发症的持续发病率和死亡率的背景下存在损害。Hence research and development dedicated to studying the coronavirus family may assist with discovering a COVID-19 specific treatment.

This chapter aims to clarify the basics of coronavirus virology, i.e. taxonomy, virion structure and molecular pathophysiology. Furthermore, the history and origins of the human coronavirus cluster (HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 and HCoV-HKU1), as well as severe epidemic/pandemic causing coronaviruses (SARS-CoV-1, SARS-CoV-2 and MERS-CoV) is highlighted. As the coronavirus research is rapidly expanding, we have emphasized on a select few novel studies on the association of human coronaviruses with angiotensin-converting enzyme 2 receptor tissue distribution, Kawasaki Disease, Renin-Angiotensin-Aldosterone-System, repurposing antiviral agents, CoV main protease (MPro) inhibitor, dexamethasone efficacy, BinaxNOW COVID-19 Ag Card and ABO blood group system.

http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_47 2021-04-24 10.1007/7653 _2020_47
用于设计新化学品的Covid-19上的分子多目标方法 抽象

由于SARS-COV-2病毒而出现的大流行情况令人沮丧的社会和经济集糟糕,仍然没有治愈可以打击这种情况。要传播世界各地的所有科学成果和数据,所有主要的科学期刊和数据库都提供了对全球内容的开放访问。由于重点研究,在很短的时间内产生了相当大量的多维数据来了解病毒的基本行为,这对于新的治疗发育是有用的。许多国家正在致力于疫苗发展;然而,对新型药水管道的进展也平行地进行,以降低死亡率。从〜30kb尺寸的病毒基因组中,鉴定了许多不同的实验表征和验证的蛋白,然后确定了3D结构测定,以更快地探索抗病毒靶标,这包括在本章中。蛋白酶总是被发现作为有前途的抗病毒靶蛋白,并且在SARS-COV-2的情况下,半胱氨酸蛋白酶如3Cl pro (chymotrypsin样蛋白酶)和pl pro (木瓜蛋白酶样蛋白酶)服务相同。在从病毒的RNA基因组中涉及从病毒的RNA基因组出来的多肽的切割过程,并且该切割有助于病毒存在所需的复制装置复杂的形成。

http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_52 2021-04-23 10.1007 / 7653_2020_52 利用人诱导多能干细胞来源的脑内皮细胞血脑屏障通透性测定的发展 抽象

在体外开发转化和预测模型,用于评估血脑屏障(BBB)递送已成为CNS靶向治疗方法临床前测试的重要要求。在这里,我们描述了一种具有鲁棒BBB性质的人诱导的多能干细胞(IPSC)的脑内内皮样细胞(BECS)的脑内内皮样细胞(BEC)。为了产生BBB渗透率测定,BEC在放置在伴随板内的半透性转发器插件上作为单层播种以产生双隔室Transwell模型。BEC在腔(血液)和ABLUMING(脑)隔室之间提供类似BBB的分离,以评估CNS靶向治疗剂的BBB渗透性。http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7651_2021_393 2021-04-22 10.1007 / 7651_2021_393 肠上皮细胞单层的建立及其在钙开关测定中的应用,以评估肠紧闭合结组件 抽象

肠道屏障函数主要依靠组装和完整性的紧密连接,这形成了尺寸选择性屏障。该屏障限制了各种上皮细胞溶质的静脉运动。注意,细胞外CA 2 + 浓度影响紧密的接线组件。因此,将Ca 2 + 中的除去和重新加入培养的肠上皮细胞的细胞培养基中引起稳定和重新组装的紧密结合到顶端附近的膜周边, 分别。基于该原理,建立了CA 2 + -Switch测定,以研究完全分化的肠上皮细胞中的紧密结组装。本章提供了使用T84细胞系作为体外模型的肠上皮细胞单层培养的逐步方案,以及CA 2 + -Switch测定,用于评估紧密结装配。http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7651_2021_347 2021-04-17 10.1007 / 7651_2021_347 高效高密度HIPSCS在简单透析装置中的扩展 抽象

ipscs是可用于再生医学的潜在细胞类型。悬浮培养是产生足够量的所需细胞的主要方法,以实现HIPSCS用于大器官移植的应用。透析培养系统通过利用内源生长因子来降低成本并同时再循环剩余的外源生长因子。然而,目前的大规模透析培养系统未得到优化以扩大高密度培养。几个问题,如大容量和技术复杂性的要求使得该系统的优化保持具有挑战性。而且,动态悬浮培养物中机械应力的干扰可以降低细胞活力,多能性和分化能力。这里,我们描述了简单的小型化透析平台,通过在粘弹性介质中的低机械应力培养环境中结合连续交换营养和毒性代谢产物的连续交换的利用率来评估高密度HIPSCS培养的可行性。http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7651_2021_391 2021-04-16 10.1007 / 7651_2021_391 人类诱导多能干细胞(IPSC)处理协议:维护,扩展和冷冻保存 摘要 >

人诱导多能干细胞(Human induced pluripotent stem cells, iPSCs)近年来已成为基础研究、疾病建模和药物发现的重要资源。鉴于诱导多能干细胞相对于其他模型的众多优势——包括其人类起源、分化成几乎任何细胞类型的能力,以及在个性化医疗中患者特异性诱导多能干细胞的治疗潜力——许多实验室现在正在考虑将诱导多能干细胞模型用于他们的研究。由于iPSC初始种群的质量是这些应用中任何一个成功的关键决定因素,因此在iPSC文化中坚持最佳实践是至关重要的。在以下协议,我们提供一个全面的指南文化、低温贮藏和质量控制方法的建立和维护所需的高质量的iPSC文化。< / p >http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7651_2021_358 2021-04-10. 10.1007 / 7651_2021_358 使用多西环素 - 诱导CRSP-CAS9系统在人诱导多能干细胞中进行基因编辑 摘要 >

诱导多能干细胞(Induced pluripotent stem cells, iPSCs)是一种有价值的工具,用于疾病建模、药物筛选和研究细胞/组织特异性基因的功能。然而,在本研究中,等基因的诱导多能干细胞系对于比较由诱导多能干细胞产生的野生型和突变型分化细胞的表型很重要。基因编辑技术的出现纠正或产生突变有助于产生具有相同遗传背景的等基因诱导多能干细胞系。由于易于编程,基于CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)- cas9的基因编辑工具在基因操作研究方面取得了进展,包括对癌症等复杂疾病的调查。在腺相关病毒整合位点1 (AAVS1)的安全港位点上,药物诱导Cas9表达的诱导多能干细胞(iPSC)提供了具有稳健基因编辑的Cas9可控表达。在这里,我们描述一个逐步协议这样的iPSC的生成和特征线(AAVS1-PDi-Cas9 iPSC)与强力霉素(阿霉素)诱导Cas9表达盒的< em类= >“a-plus-plus AAVS1 < / em >安全港网站和高效的编辑目标基因的慢病毒载体表达gRNAs。这种可调节Cas9表达的方法可以研究诱导多能干细胞或分化细胞中的基因功能,可以作为疾病建模研究的通用工具http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7651_2021_348 2021-04-09. 10.1007 / 7651_2021_348 在体内依赖于紧密结依赖性和紧密的结合独立的肠道势丧失

摘要

肠道屏障是先天宿主防御的重要组成部分。肠的单层上皮细胞必须平衡屏障功能与活性,跨细胞和扩散,细胞旁运输。紧密连接,连接相邻的细胞,形成选择性渗透性密封,定义了细胞旁运输和屏障特性。分子可以通过两种不同的途径,即孔隙和泄漏途径中的任何一种,它们在容量、电荷选择性、大小选择性以及对生理和病理生理刺激的反应方面都不同。第三种肠通透性途径,即不受限制的途径,反映了上皮屏障的丢失,就像发生在黏膜损伤时一样,它独立于细胞旁途径和细胞外途径,既没有电荷选择,也没有大小选择。

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体内测定肠通透性最常用的方法是灌胃FITC-4 kDa葡聚糖,并分析血清中恢复的数量。不幸的是,这种方法不能区分泄漏途径和不受限途径,因为4kda右旋糖酐可以同时跨越这两种途径。此外,4 kDa的葡聚糖太大,无法通过孔通道,因此无法提供有关细胞旁通量通道的信息。在这里,我们描述了一种多重方法,允许同时、独立地分析每个通路http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7651_2021_389 2021-04-09. 10.1007 / 7651_2021_389 一种体外测定,以监测Sertoli细胞血液 - 睾丸屏障(BTB)完整性 抽象

在本章中,我们详细介绍了可靠,有效,易于执行的测定以监控Sertoli Cell血液睾丸屏障(BTB)完整性。虽然睾丸中的BTB由紧密结(TJ)屏障和基底级(Ectoplasmic专业化,富含睾丸专用致密蛋白的粘附结(AJ)型)组成,但这种方法适用于所有其他血液组织屏障体外,包括血脑屏障(BBB)的内皮TJ屏障。此外,该方法不需要昂贵的设置,并且可以通过任何标准生物化学/细胞生物学/分子生物学实验室迅速执行。The basic idea is built on the concept that a functional blood–tissue barrier, such as the BTB conferred by Sertoli cells in the testis, is capable of blocking the diffusion of a small membrane impermeable biotin (e.g., EZ-Link Sulfo-NHS-LC-biotin, Mr. 556.59) across the barrier. However, when this barrier is compromised, such as following treatment with a toxicant or knockdown of a relevant gene necessary to confer the TJ-barrier function, the biotin will permeate the barrier, reaching the Sertoli cell cytosol. Biotin can be subsequently visualized by using streptavidin conjugated to a fluorescence tag such as Alexa Fluor 488 (green fluorescence) which can be easily visualized by a standard fluorescence microscope.

http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7651_2021_390 2021-04-09. 10.1007 / 7651_2021_390
通过中断重编程从血样产生人类神经祖细胞 摘要 >

人类神经细胞培养是神经系统生物学和临床前研究的重要工具。由于我们获取原始人类神经样本的途径非常有限,从微创取样获得的细胞中提取增殖神经祖细胞(NPCs)是一个关键问题。在这里,我们描述了一个“捷径”的方法建立增殖鼻咽癌培养直接从外周血单个核细胞(PBMCs)通过中断重编程。此外,我们提供了描述NPC阶段的程序http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7651_2021_386 2021-04-08 10.1007 / 7651_2021_386 基于病毒神经节苷脂相互作用的结构和分子建模研究阻止Covid-19大流行的治疗和疫苗策略 摘要

冠状病毒疾病(covid-19)是由一种被称为严重急性呼吸道的新型冠状病毒引起的传染性呼吸道疾病综合征冠状病毒2(SARS-COV-2)。感染循环从病毒尖峰S蛋白与细胞ACE-2受体的结合开始。S蛋白质具有在其中心确定受体结合结构域(RBD)的三聚体结构,而在其尖端显示平坦神经节苷脂结合域的每个亚基的N-末端结构域(NTD)被拒绝在周边。因此,三个NTDS形成了一个非常适合吸引脂质筏中的病毒的三脚架,其中神经节苷脂和ACE-2都存在。分子建模研究表明,可以阻断这种相互作用:(1)通过羟基甲基喹,其结合神经酰染色剂,(2)通过含有针对NTD的抗体与NTD的抗体结合的阿奇霉素和(3)。本章的目的是提供一些基于SARS-COV-2S蛋白的NTD的神经节苷脂结合结构域的硅藻,硅,不同治疗和疫苗策略的线索。http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_54 2021-04-06 10.1007 / 7653_2020_54 发现共价药物靶向SARS-COV-2的关键酶的使用练习型 抽象

历史上,由于可能与共价结合有关的可能毒性,在药物开发过程中避免了共价药物这种药物和细胞蛋白质。然而,近年目睹了共价药物发现的快速复苏,因为实现了共价药物在疗效,作用持续时间,治疗诱导的抗性和靶向硬目标的疗效。自2019年12月19日起,SARS-COV-2截至2020年10月19日造成了近4000万个Covid-19患者和全世界超过一百万人死亡。相比之下,尚未发现有效的药物。因此,发现和设计用于预防和治愈SARS-COV-2感染的药物具有很大的价值。最近,我们开发了一种简单但有效的方法,名称为剪刀以获取共价药物的发现。在这项工作中,我们在发现潜在的抗SARS-COV-2药物方面提供了该方法的详细方案。http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_56 2021-04-06 10.1007 / 7653_2020_56 基于深度学习的Covid-19和案例研究的药物筛选 摘要

冠状病毒传染病(covid-19),由致命严重的急性呼吸综合征冠状病毒2引起(SARS-COV-2)已被世界卫生组织宣布为大流行。这种疾病已成为世界上最糟糕的传染病,截至2020年9月造成约15.5万人的生命。缺乏疫苗和有效的药物是对这种大流行的无效管理的关键问题。考虑到这种紧急情况,已经提出了几项试验,以确定为其抗病毒态行为而闻名的市场毒品。几种现代技术,如深机器学习,用于打击这种致命的疾病,以更快的预测和更高的准确性。更有趣的是,这些研究提供了抗病毒性质的线索,并且被认为有助于有效地控制这种大流行。基于深度学习的虚拟筛查鉴定的药物将有助于解开治疗性和抗病毒性质的分子机制,并将为设计人工药物铺平道路。因此,我们专注于本章关于深度学习模型作为药物和疫苗发现的管道的综合应用,其对Covid-19具有治疗药物的影响。http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_58 2021-04-06 10.1007 / 7653_2020_58 蛋白质 - 蛋白质相互作用网络,用于鉴定新冠状病毒的新靶标 抽象

sars-cov-2(严重急性呼吸综合征coronavirus 2)是家庭中的新病毒Coronaviridae。病毒导致Covid-19,一种传染病。SARS-COV-2提供了与其他已建立的冠状病毒相比的新型临床,免疫和病理特征,例如中东呼吸综合征(MERS-COV)和严重急性呼吸综合征(SARS-COV)。在该阶段没有指示成功的抗病毒治疗或疫苗接种。已经使用了几种计算方法来快速理解病毒的发病机制和对抗病毒药物进行分类。蛋白质 - 蛋白质相互作用网络允许我们了解有助于疾病,感染和发展的致病途径,并将这些知识转化为有效的诊断和治疗策略。药物干预和治疗干预的常规方法开始随着依赖和药物途径的复杂性而发展。鉴定药物 - 目标相互作用不能最大限度地减少药物生产周期和成本,但也可以加强对未来药物和目标的认识到的认识。药物网络的目的是对聚焦的多目标化合物分类为涉及破坏复合物的不同蛋白质基团。 This promotes a network-centered viewpoint on drug action via the mapping of the goal network and offers a fresh insight into the role of polypharmacology in the drug operation. In this chapter, we shall address the available experiments and computations of protein–protein interaction methods to identify SARS-CoV-2 drugs.

http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_62 2021-04-06 10.1007 / 7653_2020_62
用于冠状病毒治疗方法的药物数据库 摘要

在2019年12月开始的11个月内,约4760万人被严重急剧感染呼吸综合征冠状病毒2(SARS-COV-2),包括11月3日触及1,215,601的死亡人数。该数量以令人震惊的速度增加2019年(Covid-19)的第二波冠状病毒疾病2019(Covid-19)。对另一个锁模的明确威胁正在迫使社会生活和经济。因此,全世界科学家们正在努力抵御当量,以发现小药物作为治疗方法和可能的疫苗来缓解世界。在过去的几个月里,计算化学和计算机辅助药物设计(CADD)通过采用强大的虚拟筛选技术(VS)和各种批准和实验药物的药物修复,令人鼓舞的承诺。本章征集并讨论了前25名小分子数据库,包括合成和天然化合物。大多数数据库都可以自由用于研究目的,可以使用多种计算技术进行战略筛选,以发现Covid-19的治疗方法。http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_66 2021-04-06 10.1007 / 7653_2020_66 对冠状病毒毒品发展的计算药物重新促使 摘要

冠状病毒是一种具有独特复制机制的单链正义RNA病毒,由非结构蛋白(nsp1-16)、结构蛋白(S、E、M、N)和若干辅助蛋白组成。非结构蛋白对病毒功能起着至关重要的作用,而结构蛋白在病毒的组装和结构中起着重要的作用。冠状病毒的人畜共患特性是造成过去和当前大流行的原因。目前由SARS-CoV-2引起的COVID-19全球大流行已在全球范围内造成感染,死亡人数已超过100万人。病毒的高传播率导致每天都有新病例出现。虽然疫苗仍然是一种理想的解决方案,但也重要的是要确定替代的潜在小分子和其他抑制SARS-CoV-2分子目标的抑制剂。本章描述了当前世界面临COVID-19大流行的情况,并详细介绍了病原体即SARS-CoV-2的分子机制。它讨论了药物再利用对SARS-CoV-2的作用,并解释了其方法。本报告旨在概述冠状病毒以及针对关键病毒靶点的药物再利用的作用和方法(这里,3CLpro作为一个案例研究),并创建一份当前计算药物发现方法的报告http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_68 2021-04-06 10.1007 / 7653_2020_68 RDRP抑制剂对新型冠状病毒(NCOV)发展的抑制剂 摘要

2019年电晕病毒疾病,称为covid-19,是一种病毒感染,可能导致急性呼吸道感染和严重肺炎,没有具体的治疗治疗。可用的药物仅用于对症浮雕。在所有靶标中,RNA依赖性RNA聚合酶(RDRP)已被证明是针对严重急性呼吸综合征Corona病毒2(SARS-COV-2)的乐观药物靶标以管理其复制过程。已由FDA批准的分子数量是RDRP抑制剂,如利巴韦林,Remdesivir,Sofosbuvir等。各种研究人员正在使用针对SARS-COV-2 RDRP酶的药物来使用报告的RDRP酶的抑制剂通过实施不同的计算方法。分子建模和化学信息学方法已被用于各种区域具有药用应用的新型分子的设计和鉴定。计算药物发现(CDD)和Silico方法的初步研究是现代药物发现实践的重要部分,它们经常应用于鉴定新药或预测化学系列的生物活性。现在,在正在进行的电晕大流行中,在Silico建模中,易于识别新型抑制剂非常有帮助。本章介绍了最近关于在与SARS-COV-2相关联的RDRP的设计和鉴定的计算和鉴定的计算和鉴定的报告。 Here, we will illustrate recently published computational studies for the identification or development of novel RdRp inhibitors applying different computational approaches, encompassing homology modeling, molecular docking, virtual screening, and molecular dynamics simulations. The chapter will also provide the reader an overall idea about a successful computational drug discovery research in this particular area of applications.

http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_51 2021-04-06 10.1007 / 7653_2020_51
ACE2介导的细胞进入抑制剂对冠状病毒毒药发育的计算模拟 抽象

冠状病毒疾病(covid-19)是由新发现的冠状病毒引起的传染病,可能导致急性冠状病毒呼吸道感染和严重的肺炎。截至2020年10月6日,全球范围的案件数量约为35,786,851人,死亡1,049,816人。不幸的是,没有批准药物或疫苗治疗人冠状病毒。可以设想几种选择来控制或预防Covid-19的新出现感染,包括疫苗,单克隆抗体,基于寡核苷酸的疗法,肽,干扰素疗法和小分子药物。但是,新的干预措施可能需要几个月才能发展。人血管紧张素转化酶2(ACE2)是SARS冠状病毒(SARS-COV)的功能受体。通过ACE2,防止病毒进入宿主细胞的药物的发展是一个有希望的方法。药物发现和发展是一个具有挑战性,耗时和昂贵的过程。计算工具可以充当虚拟快捷方式,协助探险这种长进程,并可能降低研发的成本。 During this pandemic situation, in silico tools have proven their efficacy in easy identification of novel inhibitors. In the present chapter, recent researches on the application of computational modeling approaches for the design and identification of candidates targeted against ACE2-mediated corona viral entry have been reviewed. Computational works encompassing homology modelling, molecular docking, molecular dynamics simulation, pharmacophore mapping, and quantitative structure–activity relationship (QSAR) studies involving potential inhibitors of ACE2 facilitated entry of virus have been covered in this chapter.

http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_49 2021-04-06 10.1007/7653 _2020_49
对新型冠状病毒的毒品开发的在线资源和工具 摘要:2020年3月11日,世界卫生组织宣布新型冠状病毒病(COVID-19)为全球大流行。COVID-19是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)引起的疾病,继续在全球传播。SARS-CoV-2属于正冠状病毒亚科,其基因组序列与该组其他两种高致病性成员SARS-CoV和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)具有相似性。这三名成员都被认为是在过去20年引发全球疫情的动物传染病事件中出现的。目前没有COVID-19的治愈方法、疫苗或标准治疗方案。2019冠状病毒病全球大流行已造成严重后果,发病率和死亡率达到惊人水平。计算机辅助药物设计(CADD)可以帮助快速重新利用已经被FDA批准的药物,也可以识别新的抗病毒化合物。CADD可以显著降低成本,并通过缩小潜在药物化合物的范围来加强药物开发过程。本章了解可用于新型冠状病毒药物开发的资源和工具http://link.beplay登入springer.com/10.1007/7653_2020_53 2021-04-06 10.1007 / 7653_2020_53