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分子模拟驱动的药物重新利用用于识别SARS-CoV-2非结构蛋白抑制剂
SARS-CoV-2大流行(COVID-19)迫切需要寻找一种潜在的药物分子来治疗它。重新利用fda批准的药物，通过初步计算筛选，然后进行实验……
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CADD:来自Sanjeevini与未来路向
Sanjeevini，一个全面的药物设计软件套件，已开发用于发现从蛋白质和DNA作为潜在目标的先导分子。Sanjeevini是sig的多个模块的顶点…
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利用机器学习促进力场方法改进蛋白质配体复合物的结合亲和力估计
评分功能通常用于基于结构的药物设计，以量化蛋白质配体(PL)复合物形成的潜力。在这里，我们提出了一个新的评分函数Bappl+，该函数的设计是为了
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开放获取基于GWAS, PheWAS和广泛的组学数据，积极重新利用黑色素瘤候选药物
药物再利用是一种快速、安全、廉价的药物研发方法。黑色素瘤疾病生存率低，死亡率高，诊断和治疗具有挑战性。此外，有大量的……
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开发一个用于识别多种蛋白质靶标的常见先导分子的web服务器
由于药物对单一靶点越来越无反应，表现为耐药性，或在复杂疾病和失调等情况下存在替代机制，重点正在转向多倍体。
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ChemGenome2.1: Ab Initio基因预测软件
基因预测，也被称为基因鉴定，基因发现，基因识别，或基因发现，是分子生物学的重要问题之一，受到越来越多的关注。
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蛋白质三级结构的质量评估:过去，现在和未来
蛋白质结构质量评价是蛋白质三级结构可靠预测的关键环节之一。蛋白质序列假体的构象后采样…
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基质金属蛋白酶药物设计的计算方法
基质金属蛋白酶(MMPs)是体内平衡所需的含锌酶家族。这些酶是一类重要的药物靶点，因为它们的过度表达与许多疾病有关。
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开放获取Bhageerath-H:同源/从头开始用于预测单体可溶性蛋白三级结构的混合服务器
人类基因组测序项目的出现使得数据库中的蛋白质序列数量激增。基于结构的药物发现的成功严重依赖于结构的可用性。
Bhageerath-H: A homology/ab initio hybrid server for predicting tertiary structures of monomeric soluble proteins" pagetype="rd_springer_com.journal.article_pdf" doi="10.1186/1471-2105-15-S16-S7" parentdoi="12859" parentcontenttype="Journal" contenttype="Article" publication="12859 | BMC Bioinformatics" viewtype="Article pdf download">下载(1410 KB) Bhageerath-H: A homology/ab initio hybrid server for predicting tertiary structures of monomeric soluble proteins" href="//www.pasomama.com/article/10.1186/1471-2105-15-S16-S7/fulltext.html" pagetype="rd_springer_com.journal.article_full_text" doi="10.1186/1471-2105-15-S16-S7" parentcontenttype="Journal" contenttype="Article" viewtype="Full text download" publication="12859 | BMC Bioinformatics">观点的文章文章
开放获取Sanjeevini:一个免费访问的网络服务器，用于目标定向的铅分子发现
利用结构和功能信息的计算方法有助于理解目标生物分子和候选命中之间的特定分子识别事件，并使其有可能设计…
Sanjeevini: a freely accessible web-server for target directed lead molecule discovery" pagetype="rd_springer_com.journal.article_pdf" doi="10.1186/1471-2105-13-S17-S7" parentdoi="12859" parentcontenttype="Journal" contenttype="Article" publication="12859 | BMC Bioinformatics" viewtype="Article pdf download">下载(1767 KB) Sanjeevini: a freely accessible web-server for target directed lead molecule discovery" href="//www.pasomama.com/article/10.1186/1471-2105-13-S17-S7/fulltext.html" pagetype="rd_springer_com.journal.article_full_text" doi="10.1186/1471-2105-13-S17-S7" parentcontenttype="Journal" contenttype="Article" viewtype="Full text download" publication="12859 | BMC Bioinformatics">观点的文章文章
生物可进化性的一种可能的分子度量
蛋白质表现为表型特征，通过进化压力在生命系统中保留或丢失。简单地说，生存本质上是一个生命系统合成功能性物质的能力。
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疾病和紊乱中的核酸:从DNA的“ABC”中理解生命的语言
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基于dna能量学的分析表明，原核生物中存在额外的基因
我们在此提出了一种基于DNA固有能量学预测原核基因组新基因的新方法。确定了热力学稳定性较高的区域，并对其进行了筛选。
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Bhageerath-瞄准几乎不可能的目标:推动蛋白质三级结构预测的原子模型的前沿＃
蛋白质折叠被认为是分子生物学的圣杯，即使在第一个晶体结构报告60年后，仍然难以解决。超过70,000个x射线和核磁共振结构现在…
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开放获取蛋白质-蛋白质复合物中结合位点残基的序列和结构特征:与蛋白质-核酸复合物的比较
蛋白质-蛋白质的相互作用对几种细胞过程很重要。了解蛋白质-蛋白质识别机制和预测蛋白质-蛋白质复合物的结合位点是一个长期的课题。
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DNA小分子的小槽结合:实验和计算证据
采用荧光猝灭和分子对接方法研究了8种吲哚衍生物的DNA结合能力。这些吲哚类化合物具有与少数吲哚生物碱相似的结构部分。
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蛋白质配合物中结合位点残基的鉴定与分析:基于能量的方法
理解蛋白质复合物的识别机制是生物信息学和计算生物学中具有挑战性的任务。我们开发了一种新的基于能量的方法来识别结合位点。
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ProRegIn:蛋白质原生样三级结构选择的规律性指数
仅从序列信息自动预测蛋白质三级结构仍然是计算处方难以实现的目标。将问题分为三个阶段，即二级结构预测阶段。
章
蛋白质-核酸配合物的分子动力学模拟与自由能计算
章节及会议文件
MemMap-pd:嵌入式内存块fpga的性能驱动技术映射算法
现代现场可编程门阵列(FPGA)除了查找表，还包括相当大的可配置嵌入式内存块(EMB)，以满足系统/应用程序的片上内存需求。
